全血分离获得血清的方法及步骤 谢谢

龙港装饰网 2023-06-01 21:59 编辑:从燕 186阅读

材料与方法

1.1 血清采集 MG患者全血来自2004~2005年就诊于辽宁中医学院附属医院的门诊患者。根据典型临床表现、新斯的明试验、低频重复电刺激及单纤维肌电图等确诊,无其他自身免疫性疾病,未经其他免疫抑制治疗,并参照1994年版《中医病证诊断疗效标准》辨证为脾肾虚型。正镇迅唤常人血清取自同时期健康志愿者。-70 ℃冰箱冷冻保存备用。

1.2 主要试剂 固相pH梯度干胶条IPG strip(Amersham公司产品, 非线性pH 3~10, 7 cm)。3-〔3-(胆酰胺基丙基)二甲氨基〕丙磺酸盐{3-〔(3-cholamidopropyl) dimethylamino〕-1-propanesul-fonate, CHAPS},二硫苏糖醇(DL-dithiothreitol, DTT),三丁基膦(tributyl phosphine, TBP),尿素,硫脲,碘乙酰胺(iodoacetamide, IAA),丙烯酰胺(acrylamide)、甲双丙烯酰胺(N, N'-methylenebi-sacrylamide),四甲基乙二胺(N, N, N, N-tetram-ethyl-ethylenediamine, TEMED),过硫酰胺(am-monium persulfate, APS),三羟甲基氨基甲烷〔tris (hydroxymethyl) aminomethane〕、甘氨酸(glycine, Gly)和十二烷基磺酸钠(sodium dodecyl sulfate, SDS)均为Bio-Rad公司产品。琼脂糖为华美生物公司产品。其他试剂均使用国产分析纯试剂。所有溶液均用MilliQ水配制。

1.3 主要仪器 高速冷冻离心机,德国Eppendorf公司产品;EttanTMIPGphorⅡ,Amersham Biosci-ences公司产品;P-2000分光光度仪,Hitachi公司产品;SE-600电泳仪,Amersham公司产品;纯水装置,Millipore公司产品;GS-710光密度扫描仪,Bio-Rad公司产品;冷却水循环系统,Cole-Parmer公司产品;Bruker-Daltonics AutoFlex TOF-TOF LIFTMass Spectrometer,美国Bruker-Daltonics公司产品;LCQ Deca XP Plus,美国Thermo Finnigan公司产品。

1.4 双向电泳

1.4.1 血清总蛋白质的提取及定量 血清-70 ℃反复冻融4次后,用Agilent Multiple Affinity Re-moval Column处理去除高丰度蛋白。使用Agilent 5K超滤管进行浓缩除盐,冻干回收的样品,-70 ℃保存。用裂解液(9 mol/L 尿素、4% CHAPS、 65 mmol/L DTT和cocktail酶抑制剂)进行复溶,并采用考马斯亮蓝法进行蛋白质定量。

1.4.2 等电聚焦 自-20 ℃取出的胶条,室温下平衡10 min,以500 μg上样量御凯在每份样本中加入上样缓冲液(8 mol/L尿素、2% CHAPS、1% Bio-lyte和1% TBP)以及标准蛋白质分子,上样于泡胀槽中,加入矿物油覆盖。程序设置如下:30 V 12 h,500 V 1 h,1 000 V 1 h,8 000 V 6 h。恒温20 ℃。等电聚焦电泳后IPG胶条在平衡液1(Tris-base 50 mol/L 、尿素 6 mol/L、甘油 30%、SDS 2%、溴酚蓝0.002%和DTT 100 mg)中于振荡器上振荡 15 min; 然后置入平衡液2(成分同平衡液1,用 400 mg 碘乙酰胺代替100 mg DTT)昌好同样于振荡器上振荡15 min。

1.4.3 SDS-PAGE垂直电泳 采用12.5%的均匀SDS2聚丙烯酰胺凝胶(水23.2 ml,30%丙烯酰胺溶液32.46 ml,1.5 mol/L Tris-HCl缓冲液pH 8.8 20 ml,10% SDS 0.8 ml,10% APS 0.4 ml,TEMED 3.76 μl,胶总体积80 ml)。将平衡后的IPG胶条移至凝胶的上方,胶条一端放入低分子量蛋白质标准,0.5%的琼脂糖封胶。上下槽加入电极缓冲液(Tris 5 mmol/L,Gly 192 mmol/L和SDS 0.1%)。初始电流为每块胶40 mA,电泳20 min,然后以每块胶60 mA电流,直至溴酚蓝前沿。

1.4.4 银染色 电泳结束后,采用硝酸银染色法,通过固定,硝酸银染色,显影,停显及脱色,至背景清晰。

1.5 图像分析 每个样品常规进行3次二维电泳,用GS-710光密度扫描仪对电泳后的胶图分别进行扫描,所得扫描图像输入计算机,采用Image-master软件对图像进行背景消减、蛋白质点检测和校正,获取蛋白质点的位置坐标和表达量等分析。选取 Ratio ≥1.5的蛋白质点认为有差异。所有数据的统计分析均采用SPSS 12.0软件,统计学分析采用 t 检验。

1.6 基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱分析 用手术刀片切下胶上目标条带,进行切胶、胶上胰蛋白酶酶解 20 h ,抽提酶解肽段,Zip Tip脱盐后点样,行基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)分析(飞行管长2.7 m,加速电压 20 kV ,反射电压23 kV)。将第1级质谱得到的肽片段质量指纹图谱、肽质量指纹图谱与第2级质谱得到的肽序列信息一起用来检索蛋白质数据库,找出匹配的蛋白质。

1.7 数据库检索 将质谱鉴定所得的肽质量指纹谱(peptide mass fingerprinting, PMF)数据于Bio-Works(Thermo Finnigan, San Jose, CA)软件搜索相应的库。搜索使用的数据库为IPI human蛋白库(SEQUEST结果过滤参数为:当Charge+1,Xcorr≥1.9;当Charge+2,Xcorr≥2.2;当Charge+3,Xcorr≥3.75;其中DelCN≥0.1)以及NCBI上 Homo sapiens的非冗余蛋白库(redundant data-base)。检索参数为胰蛋白酶解;氨基酸固定修饰方式为脲甲基半胱氨酸;模式为单同位素峰;肽片断最大误差控制在100 ppm;肽片断最大分子量误差为±0.5 Da;每个肽允许有1个不完全裂解位点。

2 结果

2.1 脾肾虚型重症肌无力患者血清双向电泳图谱 的建立及分析 经2-DE技术及银染色后,得到了两组血清的双向凝胶电泳图,并于相同的条件下重复实验3次。在正常对照组细胞蛋白质组双向电泳图谱上可观察到1 463±179个蛋白点,而脾肾虚型重症肌无力组可见到1 508±89个蛋白点